复旦大学基础医学院前身为上海**医学院基础医学部，建于1955年4月。1992年12月基础医学部更名为基础医学院。2000年4月，上海医科大学和复旦大学合并，组建为新的复旦大学。2001年7月27日，撤销复旦大学基础医学院、临床医学院建制，组建复旦大学医学院，2002年更名为复旦大学上海医学院。2012年9月4日，恢复复旦大学基础医学院建制。

  基础医学院以二级学科为基本单位，下设12个系（中西医结合系、法医学系、神经生物学系、药理学系、病理学系、病原生物学系、免疫学系、生理与病理生理学系、生物化学与分子生物学系、人体解剖与组织胚胎学系、细胞与遗传医学系、医学系统生物学系）；8个研究中心、研究室（药理研究中心、基因研究中心、数字医学中心、医学实验教学中心、临床技能学习中心、电镜室、p3实验室、医学教育研究室）；1个国家重点实验室（医学神经生物学国家重点实验室）；2个教育部重点实验室（分子医学教育部重点实验室、医学分子病毒学教育部/卫生部重点实验室）；2个卫生部重点实验室（糖复合物卫生部重点实验室、医学分子病毒学教育部/卫生部重点实验室）及1个上海市重点实验室（上海市医学图像处理与计算机辅助手术重点实验室）。学院现有国家一级重点学科3门（基础医学、中西医结合学、生物学），国家二级重点学科7门（人体解剖与组织胚胎学、病原生物学、病理学、中西医结合学、神经生物学、生理与病理生理学、生物化学与分子生物学）。2000年学院荣获“国家理科基础教育和教学人才培养基地”称号，2007年基础医学学科成为首批国家一级学科重点学科，并在2008年教育部一级学科评估中并列全国**，2012年入选上海高校******学科（a类）建设计划。

  基础医学院历来以师资实力雄厚、基础扎实而著称，是我国最早开展基础医学本科教学、研究生教育的单位，也是国内首批一级学科博士学位授予点和博士后流动站。原上海医科大学基础医学院有一级教授3名，二级教授8名，三级教授4名，拥有一批我国基础医学学科的创始人和开拓者，并为全国各省市培养了一大批基础医学各学科师资和学术带头人，在我国医学教育和研究发展史上具有举足轻重的地位。学院现设有本科生专业2个，博士后流动站3个，一级学科博士点6个，二级学科博士点16个，硕士点16个。目前在读本科生1076人（其中留学生85人），硕士研究生225人，博士研究生331人。现有教职员工324人，正高级教师66人，副高级教师73人、博士生导师78人，硕士生导师75名。中国工程院院士1名，国家“千人计划”1名，教育部长江特聘教授6名，国家杰出青年科学基金获得者8名，上海市“千人计划”4名。

  基础医学院始终遵循创建之初学风严谨的优良传统，注重对学生的基础训练，加强对科研工作的指导。经过半个多世纪的创业、创新，依托复旦大学的综合优势，在学科建设、人才培养、科学研究等方面取得优异成绩。学院教师主编大型参考书、全国医学教材20余部，其中“十一五”***规划教材9本，“十二五”***规划教材7本。大型参考书《现代医学微生物学》《现代免疫学》《组织学》等多次荣获国家图书奖。现有***精品课程4门（医学遗传学、局部解剖学、法医学 、医学导论），上海市精品课程14门，***教学团队1个（细胞与分子医学教学团队）。***教学成果奖2项，上海市教学成果奖（一等奖）2项，国家自然科学基金人才培养基金3项，省部级医学教育课题21项。在科学研究方面，围绕国家需求，瞄准学科前沿，凝练研究方向。近五年来获得各类***重大项目等纵向课题401项，到位科研经费数2.61亿元，横向经费1.67亿元，并取得系列研究成果。2007-2012年，获“973”项目19项，其中项目负责2项，课题负责9项；863项目5项，课题负责1项；参与重大专项28项，其中牵头7项；获得***、省部级研究成果17项，其中，国家科学技术奖自然科学二等奖1项，教育部自然科学一等奖2项，高等学校科学研究成果奖一等奖1项，上海市科学技术一等奖1项，高等学校科学研究成果奖二等奖5项，上海市科学技术二等奖2项，上海市科学技术三等奖3项，中华医学科技三等奖2项。国家自然科学基金委创新群体1个，教育部创新团队1个。其中1项研究成果被评为2011年中国十大科技进展新闻。

  复旦大学基础医学院将继续秉承学科建设为基，人才梯队建设为本，坚持“******气质、国际视野、人文情怀、科研素养”的人才培养目标，进一步夯实基础、砥砺奋进，******和推进我国基础医学教育的新发展。