医学院前身系周口卫生学校（2014年整体并入周口职业技术学院），最早可追溯到1947年中国人民解放军豫皖苏军区创办的卫生干部训练班，迄今已有70多年的办学历史，累计向社会输出大批优秀医务人员，毕业生以综合素质高、实践能力强受到用人单位的广泛好评。

医学院目前开设有康复治疗技术、中医康复技术、医学影像技术、药学4个专业。2021年5月康复治疗技术专业成功立项河南省康复治疗技术专业教学资源库建设项目。2021年康复治疗技术专业成功入选河南省首批现代学徒制示范点立项建设名单，是学校重点发展的专业之一。

医学院下设康复治疗技术、医学影像技术、药学、医学基础、实验实训中心5个教研室。学院拥有一支团结拼搏、锐意进取的管理和教学团队。现有教职工74人，高级职称11人，中级职称30人，硕士研究生16人，双师型教师32人，省、市级学术技术带头人4人，省、市级职业教育专家4人，周口市科普专家3人。学院共有60个标准化实验室，校内实训总面积达到5000多平方米，仪器设备价值2000多万元。

学校拥有附属医院1所，同时与周口市中心医院、周口市中医院、周口各县级医院等30余家二级甲等以上医院或医疗机构，以及河南省新四方制药有限公司、京东医药等多家优秀企业建立长期合作关系，成为学院学生实习的重要基地，为学院学生实习提供优越的实习和就业资源。

医学院师生参加省级技能大赛成果丰硕，近两年，学院教师获教师教学能力比赛省赛一等奖2项，三等奖2项，校级一等奖3项，二等奖2项，三等奖5项；康复治疗技术专业学生参加河南省第三届、第四届康复治疗技术专业技能大赛均荣获团体一等奖，学生获得一等奖2项，二等奖1项，三等奖1项，优秀奖2项；医学影像技术专业学生参加第四届全国职业院校医学影像技术专业实践技能大赛，获CT二等奖、超声一等奖、DR三等奖、团体三等奖等荣誉称号；医学院药学专业学生参加互联网+大学生创新创业大赛项目，获得省赛二等奖。