文山学院前身是1947年2月由云南昭通南迁至文山的国立西南师范学校，1984年4月经云南省人民政府批准成立文山师范专科学校，全国人大原副委员长楚图南先生为学校题写校名，1992年更名为文山师范高等专科学校，2009年4月，教育部批准升格为全日制普通本科院校，2018年通过教育部本科教学工作合格评估。2019年，成为云南省应用型本科人才培养示范校。2022年5月，云南省教育厅与文山州人民政府签订共建文山学院协议，学校成为全省一家厅州共建高校。