南通大学杏林学院是2005年5月经国家教育部批准成立的本科层次独立学院，2014年5月经江苏省事业单位登记管理局批准设立登记为事业单位法人。学院始建于1999年2月，前身为南通医学院杏林学院，2004年5月在原南通医学院、南通工学院和南通师范学院合并组建南通大学后，更名为南通大学杏林学院。